Berawal pada jaman Hindu-Budha, asal usul nama Desa Penidon berasal dari kata "Nidon" yang berarti Ni (Niat) dan Don (Padudon atau Perebutan) atau jika diterjemahkan maksudnya yaitu niatan untuk merebut kepercayaan warga setempat yaitu Hindu-Budha.
Kedatangan tujuh prajurit dari Mataram melalui bantaran sungai Bengawan Solo yang menyebar di daerah Plumpang di antaranya di Desa Bandungrejo, Desa Klotok, Dusun Lingit, Dusun Kerbut, Desa Penidon, Desa Trepan Kecamatan Babat, dan Desa Sembayat Gresik. Salah satu prajurit tersebut menetap di Desa ...